meme网站怎么预测(meme结果怎么分析)
今天给各位分享meme网站怎么预测的知识,其中也会对meme结果怎么分析进行解释,如果能碰巧解决你现在面临的问题,别忘了关注本站,现在开始吧!
本文目录一览:
b站上的meme是什么意思
b站上的meme意思是指在同一个文化氛围中,人与人之间传播的思想、行为或者风格。
一个常见的meme应当是如图所示的,根据一些有意思的图片来配上文字,以达到令人意想不到却发现图文完全契合的效果。(所以meme也被翻译为“梗图”。)这种基于图片的形式保留了巨大的创作空间,让每个人都可以做出属于自己的meme。
广义上是指在同一个文化氛围中,人与人之间传播的思想、行为或者风格。译为“模因”、“迷因”等,但通常被直接称为“meme”。现在多用于指一些传播性很强的图片或视频。主要流行于欧美国家。其实在很多国家都能找到类似的文化。
如中国的表情包,日本的日式冷笑话等。牛津字典中,meme的音标为 /mim/ 。大概类似于“米姆”。
B站介绍
B站一般指哔哩哔哩。 哔哩哔哩(NASDAQ:BILI;HKEX:9626),英文名称:bilibili,简称B站,是中国年轻世代高度聚集的文化社区和视频网站,该网站于2009年6月26日创建,被网友们亲切地称为“B站”。
如何使用SPDE进行基因家族分析---蛋白结构域、启动子元件、保守结构域
在进化树建完后,需要对序列的结构进行分析。这里需要区分两个概念,即蛋白结构域与保守结构域,它们两个不是一回事。从上一章,通过pfam方法同学们可以获得蛋白结构域的信息(即结构域的名字,从哪儿开始到哪儿结束),而保守结构域,它指的是在你所输入的这些序列中保守的序列是哪些。至于这些保守的序列到底能不能到蛋白结构域(即可以预测有功能的结构域)的那个层次还不好说。
保守结构域通过meme网站( MEME - Submission form (meme-suite.org) ):
选择要检测出多少保守结构域
选择text格式:
接下来开始绘图:
需要基因id以及每个基因的长度(即输入到meme网站的那些~):
需要格式化meme的结果同时也需要这些基因的ID, ID的获取:
格式化meme:
这些文件都是自动完成,大家只需要点点点就好:
绘图:
这样就完成了保守结构域的绘制。且每单击一次default colors, 颜色都会自动配置一次,然后再度点击draw即可完成颜色的更改。其他参数参照之前的说明。上一张图吧:
在上一章讲到的pfam的结果可用于提取蛋白结构域。建议同学们:如果你的文件里,基因名字过于复杂,就是含有额外信息,建议大家利用格式化的功能将这些额外去除掉,因为这些额外信息在后续的分析中基本不会用到但如果保留它们则会对后续的一些分析产生干扰。
这里要注意一个问题,如果所研究的家族有多个结构域,需要依次对它们的pfam结果进行格式化。格式化的结果类似于这样:
之后将该结果合并在一起(就是直接复制粘贴)以及上一步的基因ID+长度的那个文件输入作图模块中进行作图即可。
再就是启动子元件的展示。需要提取启动子序列,功能在这里:
执行此功能,同学们需要注意一个问题,就是你蛋白序列文件中的ID可能与gff3文件里的ID有出入,需要稍微调整,例如:
通过比较可以发现蛋白文件中的多了“.p” 而gff文件中的多了“.v1.ABR2.1”,因此需要进行替换(就是一定要保证蛋白文件中的ID与gff文件中mRNA那一行对应的ID是一样的),替换功能在这里:
当然,同学们如果不习惯用SPDE也可以用其他软件例如word替换,这里设置的替换功能,真正的用处是在执行多个关键词同时替换的时候,这种单个关键词的替换,完全展现不出威力~。替换完成后,如下:
这个文件将作为提取启动子的关键词。对基因组序列文件进行格式化:
提取的启动子如下:
将启动子放到plantcare( PlantCARE, a database of plant promoters and their cis-acting regulatory elements (ugent.be) )进行启动子序列的分析。
这里有个点儿需要注意:一个基因的启动子上有很多元件,如果将这些元件都展示在启动子上会将图整的跟食品包装袋后的条码似的,这并不利于我们展示重点想要展示的东西,因此,这里需要同学们根据自己的实验目的进行删减,例如,如果同学们想要展示的是胁迫条件下的情况,则可以将一些无关元件(如TATA等)删除,只保留重点先要展示的,这样也使得我们的研究结果一目了然。具体操作步骤与之前相同:
结果:
接下来是展示内含子和外显子的分布情况,当然还是要先处理文件,需要的是基因ID和GFF文件:
得到的文件如下:
之后画图
嗯,大致是这样子的吧
同学们在做的时候如果基因数量多,大可考虑将这些基因分成几组展示~
meme suite —— Motif分析百宝箱(二)
Motif Discovery中还包括MEME-ChIP,可对ChIP-seq或CLIP-seq数据的DNA序列进行一系列的Motif分析。该方法整合了:
1、MEMESTREME功能,用以预测Motif(de novo Motif);
2、CentriMo用以寻找输入序列中间区段内已知的Motif,适合ChIP-Seq数据检出峰所在序列上富集的已知 Motif;
3、通过工具Tomtom功能比较已知的motif进行相似性分析,并对重要的motif进行分组;
4、Spamo与CentriMo功能相似,也是对Motif进行富集;
5、FIMO功能旨在输出Motif在基因的位置信息。
MEME-ChIP具体参数可以使用默认值,或按需求更改。示意图如下:
我们以网站Sample Output中MEME-ChIP example结果为例进行说明。
meme币菠萝可靠吗
不可靠。
Meme是以Meme文化为基础的加密货币。与比特币(BTC)和以太坊(ETH)等主要加密货币相比,它的波动性相对来说比较高。这可能是因为Meme币是严重受社区驱动的代币。它们的价格通常受到社交媒体和在线社区情绪的影响。这往往带来很多波动,但也带来FOMO和金融风险。虽然确实有一些投资者通过Meme币发了财,但也有许多人由于市场波动或者投资一些诈骗性的代币而赔了钱。
拓展资料:
1、MEME,因为它的图标是一个菠萝,也有人管它叫菠萝币。这个菠萝币之前也做过免费的空投,一个人是空投了350个MEME。这个菠萝币最高时涨到1900美元一个,相当于每个人空投了66万美元,将近500万人民币!
2、MEME从Consensys开发人员乔丹莱尔 (Jordan Lyall) 的一条讽刺推文开始,他在推文中嘲笑了“食品币”的迅速出现。在推文中,他通过Notion制作了一张图片模型,描述了一个名为“The Degenerator”的项目构想。这个项目的网站允许人们通过拖拽的方式,在几分钟内启动一个新的DeFi项目。
3、在推文中,他给这个虚构的项目标记起了一个名字: MEME。他完全不知道,在他的推文发出几个小时后,有匿名人士真的创建了MEME代币。疯狂的市场使得“空气币”MEME当天的成交量就到达了120万美元。在此之后,MEME在社区的推动下逐步融入了NFT(非同质化通证)元素,并在之后的空投中,迎来了令人为之颤抖的暴涨。
4、由此来看,虽然不知道哪个空投的币会暴涨。但是,只要有空投,我们就抽空参与一下。这样的话,遇到暴涨代币的可能性就会变大,除此之外,我们在选择空投币种的时候,还需要看看空投代币背后的故事和背景,比如MEME这种既有讽刺又有NFT要素的代币就是一个很好的例证。
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